Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERVK-21P61565 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms