Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms