Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRE11P49959 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRE11P49959 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRE11P49959 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRE11P49959 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRE11P49959 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MRE11P49959 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms