Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIA2P42262 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms