Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARL1P40616 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms