Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD12P35452 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD12P35452 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms