Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PEX2P28328 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PEX2P28328 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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