Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms