Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms