Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMPD1P23109 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms