Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms