Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHGAP10645 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHGAP10645 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGAP10645 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGAP10645 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGAP10645 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGAP10645 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGAP10645 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHGAP10645 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms