Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLA1P09884 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLA1P09884 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLA1P09884 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLA1P09884 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLA1P09884 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLA1P09884 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLA1P09884 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLA1P09884 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms