Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHOP08100 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHOP08100 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms