Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms