Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CREB3O43889 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms