Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MTSS1O43312 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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