Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms