Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms