Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL13PA6NNM8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms