Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms