Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms