Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MED16Q9Y2X0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms