Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms