Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TTF2Q9UNY4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms