Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
L1RE1Q9UN81 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms