Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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