Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNA3Q9UI47 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms