Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD8

SEPT9, Septin-9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT9Q9UHD8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEPT9Q9UHD8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEPT9Q9UHD8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEPT9Q9UHD8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEPT9Q9UHD8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEPT9Q9UHD8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEPT9Q9UHD8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEPT9Q9UHD8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEPT9Q9UHD8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms