Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZMAT3Q9HA38 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms