Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms