Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXQ1Q9C009 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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