Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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