Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CARD11Q9BXL7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CARD11Q9BXL7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms