Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP4Q9BWG4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms