Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms