Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRIMPOLQ96LW4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms