Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LTV1Q96GA3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms