Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIPA1Q96FS4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms