Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CLDN23Q96B33 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLDN23Q96B33 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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