Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPS3Q969F9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms