Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG8Q8ND04 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG8Q8ND04 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms