Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYBPQ8N488 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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