Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms