Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FRMD7Q6ZUT3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FRMD7Q6ZUT3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms