Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM72Q6ZMU5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms