Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 356 ms