Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms