Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms