Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LETM2Q2VYF4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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